MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 43995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013416	AAG	2	6	24142	24147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866754
502	NC_013416	CAAT	2	8	24154	24161	50 %	25 %	0 %	25 %	261866754
503	NC_013416	ATA	2	6	24162	24167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866754
504	NC_013416	CTT	2	6	24184	24189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866754
505	NC_013416	A	6	6	24196	24201	100 %	0 %	0 %	0 %	261866754
506	NC_013416	ATAC	2	8	24259	24266	50 %	25 %	0 %	25 %	261866754
507	NC_013416	GTT	2	6	24278	24283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866754
508	NC_013416	AAC	2	6	24295	24300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866754
509	NC_013416	AAT	2	6	24327	24332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866754
510	NC_013416	ATT	2	6	24375	24380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866754
511	NC_013416	GAT	2	6	24387	24392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866754
512	NC_013416	TTA	2	6	24421	24426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866754
513	NC_013416	ATA	2	6	24430	24435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866754
514	NC_013416	ATCA	2	8	24463	24470	50 %	25 %	0 %	25 %	261866754
515	NC_013416	CAA	2	6	24502	24507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866754
516	NC_013416	AGAA	3	12	24617	24628	75 %	0 %	25 %	0 %	261866754
517	NC_013416	TTTA	2	8	24638	24645	25 %	75 %	0 %	0 %	261866754
518	NC_013416	TGA	2	6	24647	24652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866754
519	NC_013416	GTT	2	6	24666	24671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866754
520	NC_013416	A	6	6	24732	24737	100 %	0 %	0 %	0 %	261866754
521	NC_013416	TCAGG	2	10	24765	24774	20 %	20 %	40 %	20 %	261866754
522	NC_013416	TGA	2	6	24887	24892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866754
523	NC_013416	ACA	2	6	24977	24982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866754
524	NC_013416	TGA	2	6	24995	25000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866754
525	NC_013416	TTA	2	6	25056	25061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866754
526	NC_013416	T	6	6	25073	25078	0 %	100 %	0 %	0 %	261866754
527	NC_013416	ATT	2	6	25088	25093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866754
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529	NC_013416	TGGA	2	8	25129	25136	25 %	25 %	50 %	0 %	261866754
530	NC_013416	T	6	6	25185	25190	0 %	100 %	0 %	0 %	261866754
531	NC_013416	AAT	2	6	25326	25331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866754
532	NC_013416	ATA	2	6	25336	25341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866754
533	NC_013416	TAA	2	6	25372	25377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866754
534	NC_013416	GCA	2	6	25388	25393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866754
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537	NC_013416	AGC	2	6	25535	25540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866755
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539	NC_013416	GCA	2	6	25655	25660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866755
540	NC_013416	A	6	6	25732	25737	100 %	0 %	0 %	0 %	261866755
541	NC_013416	T	6	6	25750	25755	0 %	100 %	0 %	0 %	261866755
542	NC_013416	ACAGA	2	10	25776	25785	60 %	0 %	20 %	20 %	261866755
543	NC_013416	CAA	2	6	25824	25829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866755
544	NC_013416	CTG	2	6	25920	25925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866755
545	NC_013416	TTG	2	6	26064	26069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866755
546	NC_013416	TCAAG	2	10	26078	26087	40 %	20 %	20 %	20 %	261866755
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553	NC_013416	AAG	2	6	26393	26398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866756
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555	NC_013416	GTG	2	6	26513	26518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866756
556	NC_013416	AAT	2	6	26521	26526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866756
557	NC_013416	AGT	2	6	26659	26664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866756
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559	NC_013416	GTG	2	6	26807	26812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866756
560	NC_013416	TAG	2	6	26873	26878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866756
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563	NC_013416	ACA	2	6	26961	26966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866756
564	NC_013416	GATTG	2	10	26974	26983	20 %	40 %	40 %	0 %	261866756
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584	NC_013416	T	6	6	28033	28038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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590	NC_013416	CA	3	6	28141	28146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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599	NC_013416	CCG	2	6	28412	28417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866757
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601	NC_013416	ATT	2	6	28597	28602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866757
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603	NC_013416	CAA	2	6	28737	28742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866757
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609	NC_013416	T	6	6	29040	29045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013416	A	6	6	29069	29074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013416	ATAAA	2	10	29080	29089	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013416	TGC	2	6	29100	29105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_013416	GAC	2	6	29149	29154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_013416	T	6	6	29167	29172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013416	T	7	7	29194	29200	0 %	100 %	0 %	0 %	261866758
616	NC_013416	ATAA	2	8	29209	29216	75 %	25 %	0 %	0 %	261866758
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619	NC_013416	GCC	2	6	29445	29450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866758
620	NC_013416	GCG	2	6	29475	29480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866758
621	NC_013416	T	7	7	29620	29626	0 %	100 %	0 %	0 %	261866758
622	NC_013416	GCCA	2	8	29628	29635	25 %	0 %	25 %	50 %	261866758
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631	NC_013416	GTT	2	6	30196	30201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866758
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637	NC_013416	GTT	2	6	30586	30591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866758
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645	NC_013416	CGG	2	6	31069	31074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866758
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735	NC_013416	TTCA	2	8	36293	36300	25 %	50 %	0 %	25 %	261866764
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741	NC_013416	CGG	2	6	36432	36437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866765
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753	NC_013416	A	7	7	37176	37182	100 %	0 %	0 %	0 %	261866766
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757	NC_013416	GCG	2	6	37411	37416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866766
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